Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc5P32043 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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