Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Saa4P31532 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Saa4P31532 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms