Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc10P31257 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms