Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa2P31245 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa2P31245 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms