Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RxrgP28705 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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