Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col2a1P28481 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms