Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd10P28359 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms