Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja4P28235 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja4P28235 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms