Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb3P28231 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms