Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb1P28230 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms