Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfraP26618 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms