Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eif3aP23116 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif3aP23116 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms