Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HmbsP22907 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms