Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb9P20615 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb9P20615 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms