Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou5f1P20263 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms