Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifrd1P19182 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms