Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnc1P19123 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnnc1P19123 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms