Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18532 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18532 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18532 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P18532 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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