Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18530 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18530 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18530 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18530 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P18530 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P18530 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18530 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms