Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P18528 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18528 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18528 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18528 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms