Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtsdP18242 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtsdP18242 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms