Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxb1P17919 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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