Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmga1P17095 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms