Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrphP15331 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrphP15331 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrphP15331 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrphP15331 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrphP15331 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrphP15331 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrphP15331 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrphP15331 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrphP15331 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrphP15331 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrphP15331 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrphP15331 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrphP15331 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrphP15331 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrphP15331 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms