Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp54P14576 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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