Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms