Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd5P13379 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd5P13379 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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