Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx1P13297 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx1P13297 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msx1P13297 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msx1P13297 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms