Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn1P12960 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms