Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DmdP11531 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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DmdP11531 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DmdP11531 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DmdP11531 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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DmdP11531 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DmdP11531 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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DmdP11531 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DmdP11531 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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DmdP11531 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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DmdP11531 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DmdP11531 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DmdP11531 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DmdP11531 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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DmdP11531 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DmdP11531 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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DmdP11531 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DmdP11531 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms