Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spp1P10923 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms