Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms