Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Schip1P0DPB4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms