Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3cP0DOY1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms