Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms