Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sbk3P0C5K0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbk3P0C5K0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms