Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxa9P09631 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa9P09631 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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