Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a2P08122 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms