Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Egr1P08046 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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