Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa4P06798 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa4P06798 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms