Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt1P04104 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt1P04104 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt1P04104 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms