Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01673 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01673 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01673 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01673 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01673 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01673 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01673 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01673 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms