Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01653 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01653 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01653 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01653 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01653 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01653 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01653 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01653 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01653 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01653 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms