Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01648 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01648 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01648 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01648 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01648 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01648 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01648 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P01648 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01648 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms