Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01645 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01645 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01645 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01645 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01645 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01645 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01645 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01645 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01645 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms