Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp8O89110 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Casp8O89110 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms