Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dll3O88516 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dll3O88516 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dll3O88516 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms