Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms