Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms