Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnal1O88327 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnal1O88327 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnal1O88327 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms